MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI01

Total Repeats: 1425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013206	CCG	2	6	63416	63421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793016
1002	NC_013206	ACG	2	6	63437	63442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793016
1003	NC_013206	TCGGA	2	10	63492	63501	20 %	20 %	40 %	20 %	257793016
1004	NC_013206	CGT	2	6	63511	63516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793016
1005	NC_013206	GAT	2	6	63532	63537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793016
1006	NC_013206	CTT	2	6	63609	63614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793016
1007	NC_013206	GTTC	2	8	63634	63641	0 %	50 %	25 %	25 %	257793016
1008	NC_013206	CGA	2	6	63708	63713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793016
1009	NC_013206	GC	3	6	63715	63720	0 %	0 %	50 %	50 %	257793016
1010	NC_013206	CGT	2	6	63813	63818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793016
1011	NC_013206	GAT	2	6	63826	63831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793016
1012	NC_013206	GCC	2	6	63834	63839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793016
1013	NC_013206	CGA	2	6	63846	63851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793016
1014	NC_013206	AGT	2	6	63951	63956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793016
1015	NC_013206	ATC	2	6	63970	63975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793016
1016	NC_013206	GTT	2	6	63991	63996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793016
1017	NC_013206	CAA	2	6	64015	64020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793016
1018	NC_013206	CCA	2	6	64059	64064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793016
1019	NC_013206	GGA	2	6	64134	64139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793016
1020	NC_013206	TCA	2	6	64284	64289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793016
1021	NC_013206	CTC	2	6	64324	64329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793016
1022	NC_013206	ATC	2	6	64343	64348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793016
1023	NC_013206	TCC	2	6	64376	64381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793016
1024	NC_013206	GAAT	2	8	64415	64422	50 %	25 %	25 %	0 %	257793016
1025	NC_013206	CGG	2	6	64458	64463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793016
1026	NC_013206	CGGT	2	8	64472	64479	0 %	25 %	50 %	25 %	257793016
1027	NC_013206	TGA	2	6	64545	64550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793016
1028	NC_013206	GC	3	6	64561	64566	0 %	0 %	50 %	50 %	257793016
1029	NC_013206	CGA	2	6	64602	64607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793016
1030	NC_013206	CGT	2	6	64650	64655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793016
1031	NC_013206	TCC	2	6	64683	64688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793016
1032	NC_013206	TTC	2	6	64702	64707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793016
1033	NC_013206	GATG	2	8	64803	64810	25 %	25 %	50 %	0 %	257793016
1034	NC_013206	GAC	2	6	64825	64830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793016
1035	NC_013206	TTC	2	6	64930	64935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793016
1036	NC_013206	TGA	2	6	64982	64987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793016
1037	NC_013206	GC	3	6	65687	65692	0 %	0 %	50 %	50 %	257793017
1038	NC_013206	TGCG	2	8	65706	65713	0 %	25 %	50 %	25 %	257793017
1039	NC_013206	ACG	2	6	65787	65792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793017
1040	NC_013206	GAT	2	6	65854	65859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793017
1041	NC_013206	TGG	2	6	65888	65893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793018
1042	NC_013206	GAG	2	6	65935	65940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793018
1043	NC_013206	GAT	2	6	65965	65970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793018
1044	NC_013206	CGC	2	6	65981	65986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793018
1045	NC_013206	CGC	2	6	66030	66035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793018
1046	NC_013206	ATGCG	2	10	66068	66077	20 %	20 %	40 %	20 %	257793018
1047	NC_013206	GCA	2	6	66174	66179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793018
1048	NC_013206	CGA	2	6	66210	66215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793018
1049	NC_013206	CGG	2	6	66266	66271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793018
1050	NC_013206	GC	3	6	66286	66291	0 %	0 %	50 %	50 %	257793018
1051	NC_013206	CG	4	8	66313	66320	0 %	0 %	50 %	50 %	257793018
1052	NC_013206	CGG	2	6	66384	66389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793018
1053	NC_013206	TG	3	6	66393	66398	0 %	50 %	50 %	0 %	257793018
1054	NC_013206	TCCA	2	8	66428	66435	25 %	25 %	0 %	50 %	257793018
1055	NC_013206	GAG	2	6	66445	66450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793018
1056	NC_013206	GCG	2	6	66465	66470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793018
1057	NC_013206	CATC	2	8	66573	66580	25 %	25 %	0 %	50 %	257793018
1058	NC_013206	CGC	2	6	66632	66637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793018
1059	NC_013206	ACG	2	6	66658	66663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793018
1060	NC_013206	GTC	2	6	66700	66705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793018
1061	NC_013206	GT	3	6	66727	66732	0 %	50 %	50 %	0 %	257793018
1062	NC_013206	CGT	2	6	66763	66768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793018
1063	NC_013206	CGGG	2	8	66800	66807	0 %	0 %	75 %	25 %	257793018
1064	NC_013206	CGAG	2	8	66814	66821	25 %	0 %	50 %	25 %	257793018
1065	NC_013206	CG	3	6	66830	66835	0 %	0 %	50 %	50 %	257793018
1066	NC_013206	TGC	2	6	66935	66940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793018
1067	NC_013206	CAT	2	6	67044	67049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793018
1068	NC_013206	GC	3	6	67050	67055	0 %	0 %	50 %	50 %	257793018
1069	NC_013206	CG	4	8	67067	67074	0 %	0 %	50 %	50 %	257793018
1070	NC_013206	CGGGA	2	10	67128	67137	20 %	0 %	60 %	20 %	257793019
1071	NC_013206	GAG	2	6	67236	67241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793019
1072	NC_013206	GGA	2	6	67247	67252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793019
1073	NC_013206	TGG	2	6	67336	67341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793019
1074	NC_013206	GC	3	6	67353	67358	0 %	0 %	50 %	50 %	257793019
1075	NC_013206	CGG	2	6	67381	67386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793019
1076	NC_013206	TGGAGA	2	12	67426	67437	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257793019
1077	NC_013206	TAA	2	6	67443	67448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257793019
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1079	NC_013206	CATG	2	8	68193	68200	25 %	25 %	25 %	25 %	257793020
1080	NC_013206	ATC	2	6	68218	68223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793020
1081	NC_013206	GAC	2	6	68238	68243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793020
1082	NC_013206	ATA	2	6	68427	68432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257793021
1083	NC_013206	TCA	2	6	68433	68438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793021
1084	NC_013206	CCT	2	6	68635	68640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793021
1085	NC_013206	AGT	2	6	68663	68668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793021
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1087	NC_013206	CCA	2	6	69080	69085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793022
1088	NC_013206	TAT	2	6	69254	69259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257793022
1089	NC_013206	GAAT	2	8	69263	69270	50 %	25 %	25 %	0 %	257793022
1090	NC_013206	TG	3	6	69297	69302	0 %	50 %	50 %	0 %	257793022
1091	NC_013206	TTC	2	6	69308	69313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793022
1092	NC_013206	ACT	2	6	69333	69338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793022
1093	NC_013206	CAT	2	6	69353	69358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793022
1094	NC_013206	TTC	2	6	69486	69491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793023
1095	NC_013206	TC	3	6	69528	69533	0 %	50 %	0 %	50 %	257793023
1096	NC_013206	TCA	2	6	69618	69623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793023
1097	NC_013206	ATG	2	6	69657	69662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793023
1098	NC_013206	CAAC	2	8	69718	69725	50 %	0 %	0 %	50 %	257793023
1099	NC_013206	TCA	2	6	69775	69780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793023
1100	NC_013206	CATC	2	8	69825	69832	25 %	25 %	0 %	50 %	257793023
1101	NC_013206	GC	3	6	69972	69977	0 %	0 %	50 %	50 %	257793023
1102	NC_013206	CGT	2	6	70138	70143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793023
1103	NC_013206	CATAC	2	10	70178	70187	40 %	20 %	0 %	40 %	257793023
1104	NC_013206	TGA	2	6	70221	70226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793023
1105	NC_013206	GAT	2	6	70316	70321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793023
1106	NC_013206	GAA	2	6	70333	70338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793023
1107	NC_013206	GGT	2	6	70380	70385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793023
1108	NC_013206	A	7	7	70417	70423	100 %	0 %	0 %	0 %	257793023
1109	NC_013206	TCA	2	6	70425	70430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793023
1110	NC_013206	TTCA	2	8	70466	70473	25 %	50 %	0 %	25 %	257793023
1111	NC_013206	T	6	6	70503	70508	0 %	100 %	0 %	0 %	257793023
1112	NC_013206	AAC	2	6	70526	70531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793023
1113	NC_013206	TTC	2	6	70736	70741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793023
1114	NC_013206	CGA	3	9	70759	70767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793023
1115	NC_013206	TCCT	2	8	70775	70782	0 %	50 %	0 %	50 %	257793023
1116	NC_013206	CTC	2	6	70800	70805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793024
1117	NC_013206	TCC	2	6	70906	70911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793024
1118	NC_013206	ATC	2	6	70912	70917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793024
1119	NC_013206	CTG	2	6	70962	70967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793024
1120	NC_013206	TCGT	2	8	70975	70982	0 %	50 %	25 %	25 %	257793024
1121	NC_013206	CTT	2	6	70999	71004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793024
1122	NC_013206	TGA	2	6	71107	71112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793024
1123	NC_013206	TG	3	6	71168	71173	0 %	50 %	50 %	0 %	257793024
1124	NC_013206	TCG	2	6	71182	71187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793024
1125	NC_013206	TTC	2	6	71196	71201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793024
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1127	NC_013206	GCC	2	6	71406	71411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793024
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1251	NC_013206	CAG	2	6	80200	80205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793032
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1254	NC_013206	ATC	2	6	80427	80432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793032
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1373	NC_013206	CGC	2	6	88115	88120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793039
1374	NC_013206	GTC	2	6	88172	88177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793039
1375	NC_013206	GTC	2	6	88218	88223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793039
1376	NC_013206	GGA	2	6	88243	88248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793039
1377	NC_013206	CG	4	8	88370	88377	0 %	0 %	50 %	50 %	257793039
1378	NC_013206	GC	3	6	88379	88384	0 %	0 %	50 %	50 %	257793039
1379	NC_013206	TCT	2	6	88393	88398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793039
1380	NC_013206	TCT	2	6	88405	88410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793039
1381	NC_013206	GAA	2	6	88551	88556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793039
1382	NC_013206	CGGA	2	8	88614	88621	25 %	0 %	50 %	25 %	257793039
1383	NC_013206	TA	3	6	88627	88632	50 %	50 %	0 %	0 %	257793039
1384	NC_013206	T	7	7	88646	88652	0 %	100 %	0 %	0 %	257793039
1385	NC_013206	CTGT	2	8	88702	88709	0 %	50 %	25 %	25 %	257793039
1386	NC_013206	TCGTG	2	10	88781	88790	0 %	40 %	40 %	20 %	257793039
1387	NC_013206	ATG	2	6	88864	88869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793039
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1389	NC_013206	TTC	2	6	88941	88946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793039
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1391	NC_013206	AAAT	2	8	89625	89632	75 %	25 %	0 %	0 %	257793040
1392	NC_013206	TGT	2	6	89755	89760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793040
1393	NC_013206	CCCGT	2	10	89823	89832	0 %	20 %	20 %	60 %	257793040
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1395	NC_013206	ACC	2	6	90004	90009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793040
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1397	NC_013206	TTG	2	6	90200	90205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793040
1398	NC_013206	TTA	2	6	90243	90248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257793040
1399	NC_013206	TCCTGT	2	12	90269	90280	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257793040
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1402	NC_013206	ACT	2	6	90496	90501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793041
1403	NC_013206	TAG	2	6	90590	90595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793041
1404	NC_013206	GAA	2	6	90646	90651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793041
1405	NC_013206	TTGT	2	8	90733	90740	0 %	75 %	25 %	0 %	257793041
1406	NC_013206	GAAT	2	8	90771	90778	50 %	25 %	25 %	0 %	257793041
1407	NC_013206	GT	3	6	90848	90853	0 %	50 %	50 %	0 %	257793041
1408	NC_013206	CAA	2	6	91010	91015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793041
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1410	NC_013206	CAA	2	6	91023	91028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793041
1411	NC_013206	GCC	2	6	91052	91057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793041
1412	NC_013206	TGT	2	6	91079	91084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793041
1413	NC_013206	CAT	2	6	91095	91100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793041
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